Lindi më
6 janar 1882 në
Qytezë (turqisht: Ibrik Tepe), fshat shqiptar në
Trakë, jo shumë larg nga
Edreneja. Si disa fshatra të tjera të asaj krahine të banuar me shqiptarë, Qyteza kishte ruajtur me kohë gjuhën, doket dhe kostumet e të parëve. Noli e mbante fisin e vet me prejardhje nga Qyteza e
Kolonjës. I ati,
Stiliani, ndonëse trashëgoi një pronë tokë, nuk u mor me
bujqësi, po shërbeu si psalt në kishën e fshatit. E ëma,
Maria, ishte shtëpiake. Familja u shtua shumë dhe erdhi një kohë që jetesa u bë e vështirë për të. Sa qe i mitur Noli hoqi sëmundje të rënda, prandaj shkollën e nisi me vonesë. Filloren dhe të mesmen i bëri greqisht. Por me shumë ndikoi tek ai krenaria e fshatit shqiptar për të kaluarën historike dhe dashuria për shkrimin shqip. Që në bankat e shkollës iu shfaqën karakteri i pavarur dhe fryma e revoltës. Për këtë shkak nuk iu dha diploma në kohën e duhur, gjë që e pengoi të emërohej mësues atë vit shkollor. Më
1900 vajti në
Greqi, me qëllim që të nxirrte jetesën dhe të ndiqte fakultetin e filozofisë. Në
Athinë u lidh me një shoqëri belge, e cila zotëronte tramvajet me kuaj. S'i eci mbarë. Studime nuk i bëri. Atëherë u hodh në punë të tjera, si kopist, sufler dhe aktor pranë një trupe greke teatri shëtitës. Tek punonte atje, iu ngjall dëshira të mërej me dramaturgji. Më
1903 kaloi në
Egjipt, ku zuri punë si mësues i greqishtes. Ndërkohë, njihet me lëvizjen kombëtare. I ndihmuar nga patriotë, nis veprimtarinë politike dhe letrare: shkruan artikujt publicistikë, përkthen greqisht »
Shqipëria ç'ka qenë, ç'është dhe ç'do të bëhet« të
Sami Frashrit. Nga viti 1908 deri më 1912 kryen studimet e larta për arte në
Universitetin e Harvardit, të cilat i përfundon me
cum laude në
Bachelor of Arts. Në fund të jetës së tij shkon në
Florida. Atje, në banesën e tij, në
Fort Lauderdale, vdiq më
13 mars 1965, larg
atdheut të shtrenjtë, që e deshi me zjarr të pashuar. Fan Noli është varrosur në
Forrest Hill Cemetery, të
Bostonit.